1、在Workflows Browser中，双击流程 "16. Make OTU Table and Assign Taxonomy Pipeline" ，弹出通过流程创建项目对话框，并设置项目名称和工作目录。

2、双击打开项目，在项目编辑窗口空白处，点击右键菜单 "Create OTU Cluster Config File"，弹出创建配置文件对话框。

3、点击 "Add Fastq Files" 按钮添加原始测序数据，并设置匹配的文件后缀名，具体操作说明见界面提示，然后点击 "OK" 按钮。

4、在项目编辑窗口中，将会生成一个 "otuCls_config.txt" 文件，可以作为分析模块的输入。连线并运行项目即可得到分析结果。

5、"otuCls_config.txt" 文件，制表符分隔的文本文件，第一列为样品名，第二列为PE测序一端FASTQ原始测序数据的绝对路径，第二列为另一端FASTQ原始测序数据的绝对路径。

KO1	D:\16s.raw.data\KO1_1.fq	D:\16s.raw.data\KO1_2.fq
KO2	D:\16s.raw.data\KO2_1.fq	D:\16s.raw.data\KO2_2.fq
KO3	D:\16s.raw.data\KO3_1.fq	D:\16s.raw.data\KO3_2.fq